1941-1945:
Le 29 mars 1941, il reçoit son permis d’expert navigateur pour voiliers, valable pour « tous les océans ».

Le 2 juillet 1941, il est nommé sous-lieutenant du corps de réserve de la Marine américaine. Lorsque les États-Unis entrent en guerre en 1941, il est affecté en Australie où il coordonne les activités des services de renseignements.

	Pendant la Seconde Guerre mondiale, Ron Hubbard servit comme Lieutenant dans la Marine américaine.

De retour aux États-Unis en mars 1942, il prend le commandement d’un escorteur de convoi dans l’Atlantique, puis d’un chasseur de sous-marins dans le Pacifique. Il servira aussi son pays comme instructeur et officier de navigation en chef, puis sera sélectionné pour l’école militaire gouvernementale de l’université de Princeton.
Au début de 1945, alors qu’il se remet de ses blessures de guerre à l’hôpital naval de Oak Knoll, M. Hubbard conduit une série de tests et d’expérimentations sur le système endocrinien.
Il découvre alors que, à l’encontre de toutes les vieilles croyances en vigueur, la fonction détermine la structure et non pas le contraire. Grâce à cette percée révolutionnaire, il commence à appliquer ses théories au domaine du mental.

1946:
De retour à la vie civile en février 1946, M. Hubbard revient à l’écriture, bien que son inclination première reste le développement d’un moyen d’améliorer la condition humaine. Il continue également d’écrire afin de financer sa recherche.